Cette UE a pour objectif l’acquisition des concepts et outils en épidémiologie et de leur application pour la surveillance et le contrôle des maladies des plantes, des épizooties et zoonoses. Au travers de thématiques de recherche régionales (maladies des plantes dues à des virus-bactéries-champignons, chiroptères et leptospirose, tiques et rickettsiose, moustiques et arboviroses...), l’enseignement dispensé visera à montrer comment la santé végétale, animale ou humaine est étroitement liée à celle des écosystèmes.

• Introduction à l'écologie de la santé (approche transversale one health / ecohealth) et à l’épidémiologie. Changements environnementaux et émergences de maladies. Reconstruction des histoires d’émergence d’agents pathogènes. Résistance aux pesticides d’agents pathogènes. Exemples de prise en compte de l’épidémiologie dans les stratégies de lutte vis-à-vis d’agents pathogènes telluriques, à dissémination aérienne, vectés par des insectes. Biodiversité terrestre (vertébrés) et évolution des agents infectieux. Epidémiologie spatiale.

• TD : Présentation orale d’analyses d’articles par les étudiants. TP: Visite de laboratoire ; analyse de jeux de données VNTR - inférences phylogénétiques et reconstruction d'épidémies passées à partir de séquences nucléotidiques.

• ECTS: 4

• Nombre d'heures: 27 h CM ; 6 h TD ; 7 h TP

• Langue d’enseignement : français

• Responsable pédagogique : Stéphane Poussier

• Semestre 3